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容天 GROMACS 优化的 GPU 系统


2020-9-1


    容天通过提供用于加速生物分子模拟的高性能 GPU 系统,为 GROMACS 用户开发了交钥匙解决方案。


    每个系统的设计都根据每个用户的预算在 CPU,GPU,内存和存储之间实现了适当的平衡。


    从工作站到超级计算机,每个系统均具有高度可扩展性,并提供 3 年保修和支持。


    更快地完成 MD 仿真并不需要花费很多。我们的 GROMACS GPU 工作站起价为 50,000元。


即插即用


    容天系统是完全交钥匙的,可以直接使用,因此可以避免配置和设置的麻烦。


保证加速性能


    NVIDIA GPU 用于非结合力计算,Intel Xeon 处理器用于结合力和晶格求和。我们的系统具有最新的 GPU,包括 NVIDIA Tesla  A100、V100S、Quadro RTX 8000 等,可进行更快的 GROMACS 仿真。


预先配置系统


    通过示例作业提交脚本,基准测试,经过全面验证的测试套件以及最新的软件补丁,可以快速实施。


专注更多科学研究!


    您的系统有 3 年保修和支持,请放心,专注于最重要的事情。


建议的 GROMACS GPU 系统


SCW 工作站


MD专用GPU工作站双Intel Xeon性能高端仿真工作站

SCW4000-G2

SCW4150-G2SCW4350-G2

1个Intel Xeon 可扩展

2个Intel Xeon可扩展(金牌)2个Intel Xeon可扩展(金牌)

2个NVIDIA Geforce/Quadro


2个NVIDIA Geforce/Quadro4个NVIDIA Geforce/Quadro
4个16GB内存12个16GB内存12个32GB内存

1个512GB SSD(OS)

一个4TB HDD(数据)

1个512GB SSD(OS)

1个8TB HDD(数据)

1个512GB SSD(OS)

1个8TB HDD(数据)

适用于小型仿真的预算友好型系统。双处理器工作站,用于更复杂的仿真。高端处理器和内存配置可提供出色的性能。


容天 GROMACS GPU 服务器和工作站保证了高性能结果


    GPU 计算的新范例将超级计算机的高性能与台式计算机的外形尺寸、可承受性和能效相结合。容天根据 GROMACS 软件的使用特点,设计了一系列经过优化的 GROMACS 服务器和工作站,这些服务器和工作站可为广泛的研究活动提供最佳的价格和性能。


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GROMACS 2018.3 在容天工作站上的性能(ns /天)


GPU 加速的 GROMACS 服务器可实现更快的 MD 仿真


    GROMACS 是一种通用的软件包,可以执行分子动力学,即模拟具有数百至数百万个粒子的系统的牛顿运动方程。通过利用 NVIDIA GPU 的 CUDA® 并行处理架构,GROMACS CUDA GPU 加速现已成为 GROMACS 的核心部分,可与 GROMACS 的域分解和负载平衡代码结合使用,与纯 CPU 处理相比,性能可提高 5 倍。


    通过 VMD 和光线跟踪将您的 MD 变为现实


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    VMD 设计用于对蛋白质,核酸,脂质双层组件等生物系统进行建模,可视化和分析。 VMD 包括 Tachyon 射线追踪引擎的新内置 GPU 加速版本,使用 NVIDIA CUDA 和 OptiX 达到的性能水平是 Tachyon 现有 CPU 版本的六倍(可从伊利诺伊大学获得免费用户许可)。 


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