AMBER 认证的 GPU 系统

2020-9-1

容天 AMBER 优化的 GPU 加速系统

    更快地完成 MD 仿真并不需要花费很多。我们的 AMBER GPU 工作站性价比极高。

加速 Amber MD

    最新的 GPU 硬件有 Tesla A100 、V100S、 Quadro RTX 8000 等，可运行更快的AMBER MD 仿真。

预配置

    通过示例作业提交脚本，基准测试，经过全面验证的测试套件以及最新的软件补丁，可以快速实施。

即插即用

    容天系统是完全交钥匙的，可以直接使用，因此可以避免配置和设置的麻烦。

用于分子动力学的 AMBER GPU 系统

找到最适合您的需求

借助容天系统提高 AMBER 18 性能来看到差异

»DHFR NVE HMR 4fs  

显式溶剂 PME 基准

»DHFR NPT HMR 4fs  

»DHFR NVE 2fs  

»DHFR NPT 2fs  

»STMV NPT HMR 4fs  

»FactorIX NVE  

»FactorIX NPT  

»Cellulose NVE  

»Cellulose NPT  

隐式溶剂GB基准

»TRPCage  

»Myoglobin  

»Nucleosome  

容天系统中可用的 AMBER 18

    AMBER 18 软件包通过添加 pmemd 程序在 AmberTools18 上构建，该程序类似于 AmberTools 中的 sander（分子动力学）代码，但在多个 CPU 上提供了更好的性能，并在 GPU 上显着提高了速度。  

主要的新功能包括

    GPU 上的自由能计算

    GPU 支持 12-6-4 离子电势

    CPU 并行性的域分解

    用于 pmemd 的微调弹性带计算（CPU 和部分 GPU 实施）

    恒定的氧化还原电位计算，以补充恒定的 pH 模拟

    支持和支持 NVIDIA 最新的 Maxwell，Pascal 和 Volta GPU。

    适用于先进力场（包括 AMOEBA）的新 pmemd.gem 代码

容天 AMBER 认证的 GPU 系统

    开发 AMBER GPU 的主要推动力是以经济的价格，高的能效以及可让最广泛的研究人员受益的系统，将超级计算机的功能和性能带入单个台式机。容天与 AMBER 开发团队合作，设计了一系列 AMBER GPU 计算解决方案，为 AMBER 用户提供最佳的价格性能。

    所有容天 AMBER 系统都预装了最新版本和更新。每个系统都是完全交钥匙的，可以立即使用，并提供有保证的性能。这为科学家提供了一种解决方案，以获取用于运行 GPU AMBER（以及常规 CPU AMBER 仿真）的最佳工作站和群集。