AMBER认证的GPU系统

 

容天 AMBER优化的GPU加速系统

更快地完成MD仿真并不需要花费很多。我们的AMBER GPU工作站性价比极高。

加速Amber MD

最新的GPU硬件具有Tesla A100 、V100S、 Quadro RTX 8000等,可运行更快的AMBER MD仿真。

预配置

通过示例作业提交脚本,基准测试,经过全面验证的测试套件以及最新的软件补丁,可以快速实施。

即插即用

容天系统是完全交钥匙的,可以直接使用,因此可以避免配置和设置的麻烦。

用于分子动力学的AMBER GPU系统

找到最适合您的需求

MD专用GPU工作站

Intel Xeon性能

高端仿真工作站

SCW4000-G2

SCW4150-G2

SCW4350-G2

1Intel Xeon 可扩展

2Intel Xeon可扩展(金牌)

2Intel Xeon可扩展(金牌)

2NVIDIA Geforce/Quadro

2NVIDIA Geforce/Quadro

4NVIDIA Geforce/Quadro

416GB内存

1216GB内存

1232GB内存

1512GB SSDOS

一个4TB HDD(数据)

1512GB SSDOS

18TB HDD(数据)

1512GB SSDOS

18TB HDD(数据)

适用于小型仿真的预算友好型系统。

双处理器工作站,用于更复杂的仿真。

高端处理器和内存配置可提供出色的性能。

 

借助容天系统提高AMBER 18性能来看到差异

»DHFR NVE HMR 4fs  

显式溶剂PME基准

 

»DHFR NPT HMR 4fs  

»DHFR NVE 2fs  

»DHFR NPT 2fs  

»STMV NPT HMR 4fs  

»FactorIX NVE  

»FactorIX NPT  

»Cellulose NVE  

»Cellulose NPT  

隐式溶剂GB基准

»TRPCage  

»Myoglobin  

»Nucleosome  

容天系统中可用的AMBER 18

AMBER 18软件包通过添加pmemd程序在AmberTools18上构建,该程序类似于AmberTools中的sander(分子动力学)代码,但在多个CPU上提供了更好的性能,并在GPU上显着提高了速度。  

主要的新功能包括

  • GPU上的自由能计算
  • GPU支持12-6-4离子电势
  • CPU并行性的域分解
  • 用于pmemd的微调弹性带计算(CPU和部分GPU实施)
  • 恒定的氧化还原电位计算,以补充恒定的pH模拟
  • 支持和支持NVIDIA最新的Maxwell,Pascal和Volta GPU。
  • 适用于先进力场(包括AMOEBA)的新pmemd.gem代码
 

容天 AMBER认证的GPU系统

开发AMBER GPU的主要推动力是以经济的价格,高的能效以及可让最广泛的研究人员受益的系统,将超级计算机的功能和性能带入单个台式机。容天与AMBER开发团队合作,设计了一系列AMBER GPU计算解决方案,为AMBER用户提供最佳的价格性能。

所有容天 AMBER系统都预装了最新版本和更新。每个系统都是完全交钥匙的,可以立即使用,并提供有保证的性能。这为科学家提供了一种解决方案,以获取用于运行GPU AMBER(以及常规CPU AMBER仿真)的最佳工作站和群集。